Дефицит продуктов питания и тепла, бомбардировки и артобстрелы провоцировали туберкулёз, сыпной и брюшной тиф, дизентерию и инфекционный гепатит, а тяжелейший голод приводил к нетипичному течению заболеваний.
По инициативе Ленинградского Дома санитарного просвещения выходит целая серия плакатов по гигиене и профилактике болезней, в том числе призыв: «Заразного больного отправьте немедленно в больницу. Больной брюшным тифом или дизентерией — источник распространения этих болезней».
На берегах Ладожского озера установили санитарно-контрольные пункты, санитарно-эпидемиологические лаборатории, инфекционные госпитали, банно-прачечные отряды.
В самом городе проводилась массовая иммунизация, был введён карантин для прибывающих, издан приказ об обязательной госпитализации всех лиц с высокой температурой неясного происхождения.